Приказом МО РФ за № 967 от 13 марта 2001 года получена лицензия по направлению подготовки дипломированных специалистов:
- 3112 «Технология производства и переработки сельскохозяйственной продукции»;
- 3119 «Технология обслуживания и ремонта машин в агропромышленном комплексе».
25 апреля 2001 г. решением Ученого Совета № 08 на основании приказа МО РФ № 967 от 13 марта 2001 г. о лицензировании 2-х специальностей открыта аграрная кафедра, которую возглавил доктор сельскохозяйственных наук, профессор Шевхужев Анатолий Фоадович.
Приказом МО РФ за № 323 от 31.01.2003 г. получена лицензия на право осуществления образовательной деятельности по специальности 3108 «Ветеринария».
Приказом МО РФ за № 355 от 03.02.2003 г. получена лицензия на право осуществления образовательной деятельности по специальности 1706 «Машины и аппараты пищевых производств».
На основании решения Ученого совета от 26 марта 2003 г. ректором академии издан приказ за № 155/0 от 27 марта 2003 г. об организации аграрного факультета с двумя кафедрами:
- Технология производства и переработки сельскохозяйственной продукции (ТПиПСХП);
- Надежность и технический сервис машин;
10.10.2003 г. приказом № 567/0 кафедра НГ и ИГ переименована в кафедру МАП и ИГ, которая этим же приказом передана аграрному факультету.
Приказом МО РФ 10 декабря 2003 года открыта специальность 060800 «Экономика и управление на предприятии АПК».
Приказом № 695/0 от 15.12.2003 года организована предметная комиссия «Ветеринария» в составе кафедры ТПиПСХП. Председателем предметной комиссии назначен кандидат с.-х. наук, доцент Гочияев Х.Н.
Приказом № 219/0 от 20 апреля 2004 г. организована предметная комиссия «Экономика и управление на предприятии АПК». Председателем предметной комиссии назначена доктор экон. наук Попова Е.В.
Приказом № 220/0 от 20 апреля 2004 г. организована предметная комиссия «Переработка сельскохозяйственной продукции». Председателем предметной комиссии назначен доктор с-х наук, доцент Мамбетов М.М.
Приказом Федеральной службы по надзору в сфере образования и науки от П.05.2005г. Карачаево-Черкесская Государственная Технологическая Академия (КЧГТА) получила лицензии на право осуществления образовательной деятельности по специальностям «Агрономия» и «Технология хлеба, кондитерских и макаронных изделий».
Приказом МО РФ за № 1500 от 03.06.2010 г. получена лицензия на право осуществления образовательной деятельности по направлению подготовки 250100 «Лесное дело».
Качество подготовки специалистов в Аграрном институте обеспечивается, в первую очередь, уровнем подготовки профессорско-преподавательского состава. В институте работают 34 сотрудника, в том числе: 28 человека – профессорско-преподавательского состава, 6 человек – учебно-вспомогательного персонала.
В штате профессорско-преподавательского состава института 3 доктора наук, 17 кандидатов наук.
В институте на одной специальности и четырех направлениях подготовки бакалавров обучаются 598 чел.
В структуре института 2 кафедры:
- кафедра «Ветеринарная медицина» (зав. кафедрой – канд. с.-х. наук, доцент Гочияев Хусей Нурчукович);
- кафедра «Агрономия и лесное дело» (зав. кафедрой – канд. экон. наук, доцент Гедиев Керим Таубиевич).